Bagi sebagian besar ninja, memiliki kemampuan fisik yang kuat mejadi faktor penentu dalam pertarungan. Dengan fisik yang kuat dan juga daya tahan pertarungan yang bagus akan menjadi ninja yang hebat.
Namun tidak bagi ninja-ninja dibawah ini, mereka mengandalkan kepintaran mereka dalam menghadapi musuh. Berikut ini adalah ninja yang terpintar dalam serial Naruto
Nara Shikaku
Kepintaranya tidak perlu diragukan! Dia bahkan menjadi pemimpin divisi strategi dalam perang ninja ke 4 dan membawa kemenangan bagi pihaknya. Bahkan raikage ke 4 memuji dirinya, dan mengerti kenapa Konoha sangat sulit ditaklukan karena memiliki ninja hebat seperti dirinya.
Nara Shikamaru
Buah jatuh tidak jauh dari pohonya, ungkapan itu adalah yang cocok bagi Shikamaru. Mewarisi kepintaran dari Ayahnya, membuat Shikamaru termasuk ninja yang sangat pintar. Bahkan seluruh teman-temannya sangat mempercayai dirinya dalam membuat strategi. Sekarang dia menjabat sebagai penasihat dari Hokage ke 7 karena kepintarannya.
Namikaze Minato
Minato juga merupakan salah satu ninja terpintar yang ada dalam serial ini. Kemampuannya dalam menganalisis ninjutsu dan mempelajarinya serta memodifikasinya adalah bukti dari kejeniusannya. Dia juga merupakan pemikir yang cepat dalam pengambilan keputusan.
Senju Tobirama
Memang dari segi kekuatan, dia tidak sekuat kakaknya yaitu Senju Hashirama. Namun dari segi kemampuan berfikir, dia adalah orang yang sangat berjasa dalam dunia ninja di Naruto. Dia menciptakan system yang diadaptasi oleh banyak desa seperti sistem ANBU, Kepolisian Konoha dan Akademi. Selain itu banyak jutsu yang lahir dari kemampuan berpikirnya, seperti Kage Bunshin dan Edo Tensei.
Uchiha Itachi
Memiliki kemampuan seperti sharingan saja sudah merupakan sebuah keuntungan dalam pertarungan di Naruto. Namun Itachi juga melengkapi dirinya dengan kemampuan berpikir yang hebat. Bahkan Hiruzen memuji dirinya yang mampu berpikir seperti Hokage dalam usia muda. Bisa dibayangkan bukan betapa pintarnya Itachi?
Sarutobi Hiruzen
Menjabat sebagai hokage ketiga sudah memperlihatkan betapa kuat dirinya. Selain itu dia juga memiliki kepintaran diatas rata-rata sehingga mendapat julukan Professor dalam dunia shinobi karena kepintarannya yang bahkan bisa menguasai ke 5 element dasar secara murni.
Orochimaru
Salah satu legenda Sannin ini adalah ninja yang pintar bahkan bisa dibilang seorang ilmuan yang gila. Tidak hanya dalam pertempuran, kepintarannya juga dalam hal penelitian dan dalam penggunaan teknologi. Bahkan dia bisa membuat sendiri anak buatannya yaitu Mitsuki.
